细胞治疗产品的安全性依赖于细胞的来源、生产过程、非细胞组分以及其特殊的治疗作用。细胞组分的多样性会在不同水平上对患者、医务人员或一般人群造成危害。影响细胞治疗安全性的因素包括:细胞来源(自体‐异体)。细胞操作的水平(体外、离体、激活、基因操作)。复合产品(细胞+生物活性分子或结构性材料)。最好的策略是把ES细胞诱导分化为功能细胞或者某种细胞的前体细胞后再移植到体内,也可以提供设计自杀基因,当移植的干细胞向肿瘤发展时,自身基因发挥作用导致细胞死亡。细胞在体外传代或分裂过程中,基因需要不断复制,而在正常情况下就有可能发生突变,其突变具累积效应,大约每3个细胞分裂一次就有一次突变发生。
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