酵母是能利用信号序列对外源基因产物加以正确折叠、糖基化和分泌,且具有不需要特殊的培养基便能迅速生长和大规模发酵的优点,同时它没有内毒素、无溶源性病毒、无致病性,使得它比大肠杆菌更加适合于对外源基因产物加以大规模的工业化生产。人们较为熟悉的啤酒酵母(Saccharomycesserevisiae)生产了第一个商业化的重组疫苗,但是它的糖基化功能还不是十分完备,利用它来生产抗体时,产生的抗体具有抗原结合活性和ADCC作用,但是不能引起人的补体反应,同时利用啤酒酵母生产抗体时。除了啤酒酵母和毕赤酵母以外,其他一些酵母,如裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)等也逐渐展现出在基因工程药物生产中的发展前景。
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